MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC64

Total Repeats: 1103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020797	GCC	2	6	37	42	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464773
2	NC_020797	TCG	2	6	70	75	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464773
3	NC_020797	GC	3	6	111	116	0 %	0 %	50 %	50 %	470464773
4	NC_020797	GCA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464773
5	NC_020797	GATC	2	8	839	846	25 %	25 %	25 %	25 %	470464774
6	NC_020797	GGT	2	6	862	867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464774
7	NC_020797	CCG	2	6	877	882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464774
8	NC_020797	A	7	7	1121	1127	100 %	0 %	0 %	0 %	470464775
9	NC_020797	ACC	2	6	1174	1179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464775
10	NC_020797	TCG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464775
11	NC_020797	ATC	2	6	1306	1311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464775
12	NC_020797	GCT	2	6	1352	1357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464775
13	NC_020797	CG	3	6	1787	1792	0 %	0 %	50 %	50 %	470464776
14	NC_020797	CAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470464776
15	NC_020797	GC	3	6	1918	1923	0 %	0 %	50 %	50 %	470464776
16	NC_020797	GCG	2	6	1954	1959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464776
17	NC_020797	TACG	2	8	1992	1999	25 %	25 %	25 %	25 %	470464776
18	NC_020797	AAG	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470464776
19	NC_020797	GGC	2	6	2059	2064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464776
20	NC_020797	CG	3	6	2076	2081	0 %	0 %	50 %	50 %	470464776
21	NC_020797	CCG	2	6	2096	2101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464776
22	NC_020797	GCC	2	6	2102	2107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464776
23	NC_020797	CGG	2	6	2518	2523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464777
24	NC_020797	CTCG	2	8	2599	2606	0 %	25 %	25 %	50 %	470464777
25	NC_020797	CCG	3	9	2610	2618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464777
26	NC_020797	GCT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464777
27	NC_020797	TGC	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464777
28	NC_020797	GC	3	6	2674	2679	0 %	0 %	50 %	50 %	470464777
29	NC_020797	CCG	2	6	2692	2697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464777
30	NC_020797	CGGC	2	8	2702	2709	0 %	0 %	50 %	50 %	470464777
31	NC_020797	GCCG	2	8	2776	2783	0 %	0 %	50 %	50 %	470464777
32	NC_020797	GCG	3	9	2786	2794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464777
33	NC_020797	CCA	2	6	2799	2804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464777
34	NC_020797	CCGC	2	8	2865	2872	0 %	0 %	25 %	75 %	470464777
35	NC_020797	CGC	2	6	2937	2942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464778
36	NC_020797	CCG	2	6	2959	2964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464778
37	NC_020797	CG	3	6	2991	2996	0 %	0 %	50 %	50 %	470464778
38	NC_020797	GCCAT	2	10	3092	3101	20 %	20 %	20 %	40 %	470464778
39	NC_020797	GCG	2	6	3102	3107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464778
40	NC_020797	CG	3	6	3106	3111	0 %	0 %	50 %	50 %	470464778
41	NC_020797	CCA	2	6	3145	3150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464778
42	NC_020797	TGG	2	6	3161	3166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464778
43	NC_020797	CTG	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464778
44	NC_020797	CGC	2	6	3201	3206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464778
45	NC_020797	TTG	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464778
46	NC_020797	CGCC	2	8	3309	3316	0 %	0 %	25 %	75 %	470464778
47	NC_020797	GC	3	6	3339	3344	0 %	0 %	50 %	50 %	470464778
48	NC_020797	TGC	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464778
49	NC_020797	GGC	2	6	3424	3429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464778
50	NC_020797	GCATT	2	10	3455	3464	20 %	40 %	20 %	20 %	470464778
51	NC_020797	CAC	2	6	3469	3474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464778
52	NC_020797	GAAC	2	8	3494	3501	50 %	0 %	25 %	25 %	470464778
53	NC_020797	ACG	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
54	NC_020797	CCA	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464779
55	NC_020797	CCG	2	6	3523	3528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464779
56	NC_020797	AGC	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
57	NC_020797	GCA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
58	NC_020797	TGC	2	6	3604	3609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464779
59	NC_020797	GCG	2	6	3622	3627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464779
60	NC_020797	GCG	2	6	3756	3761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464779
61	NC_020797	CAG	2	6	3773	3778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464779
62	NC_020797	CG	3	6	3794	3799	0 %	0 %	50 %	50 %	470464779
63	NC_020797	A	6	6	4011	4016	100 %	0 %	0 %	0 %	470464779
64	NC_020797	CAG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464780
65	NC_020797	GCC	2	6	4621	4626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464780
66	NC_020797	CTG	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
67	NC_020797	GCG	2	6	4689	4694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464780
68	NC_020797	TTG	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464780
69	NC_020797	TGC	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
70	NC_020797	GGCCG	2	10	4828	4837	0 %	0 %	60 %	40 %	470464780
71	NC_020797	CAA	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470464780
72	NC_020797	CTG	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
73	NC_020797	TCT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470464780
74	NC_020797	CGC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464780
75	NC_020797	TCG	2	6	5105	5110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
76	NC_020797	GAAT	2	8	5136	5143	50 %	25 %	25 %	0 %	470464780
77	NC_020797	CCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464780
78	NC_020797	GCGA	2	8	5184	5191	25 %	0 %	50 %	25 %	470464780
79	NC_020797	T	6	6	5199	5204	0 %	100 %	0 %	0 %	470464780
80	NC_020797	AGC	2	6	5231	5236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464780
81	NC_020797	GTG	2	6	5252	5257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464780
82	NC_020797	TGC	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
83	NC_020797	GCTG	2	8	5406	5413	0 %	25 %	50 %	25 %	470464780
84	NC_020797	CAG	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464780
85	NC_020797	CTG	2	6	5422	5427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
86	NC_020797	TCCT	2	8	5428	5435	0 %	50 %	0 %	50 %	470464780
87	NC_020797	CG	3	6	5456	5461	0 %	0 %	50 %	50 %	470464780
88	NC_020797	GTG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464780
89	NC_020797	CGG	2	6	5577	5582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464780
90	NC_020797	GCCA	2	8	5606	5613	25 %	0 %	25 %	50 %	470464780
91	NC_020797	CTG	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
92	NC_020797	GGA	2	6	5671	5676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470464780
93	NC_020797	GTT	2	6	5681	5686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464780
94	NC_020797	GCT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464780
95	NC_020797	CA	3	6	5725	5730	50 %	0 %	0 %	50 %	470464780
96	NC_020797	CGC	2	6	5923	5928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
97	NC_020797	GGCC	2	8	6027	6034	0 %	0 %	50 %	50 %	470464781
98	NC_020797	CCA	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464781
99	NC_020797	GAT	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464781
100	NC_020797	CCG	2	6	6194	6199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
101	NC_020797	AAG	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470464781
102	NC_020797	CTC	2	6	6229	6234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470464781
103	NC_020797	TTG	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464781
104	NC_020797	GGC	2	6	6247	6252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
105	NC_020797	TCG	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
106	NC_020797	TGG	2	6	6384	6389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464781
107	NC_020797	GCA	2	6	6429	6434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
108	NC_020797	CCGG	2	8	6519	6526	0 %	0 %	50 %	50 %	470464781
109	NC_020797	CAG	2	6	6577	6582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
110	NC_020797	AAC	2	6	6722	6727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470464781
111	NC_020797	GTA	2	6	6751	6756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464781
112	NC_020797	CCA	2	6	6764	6769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470464781
113	NC_020797	GCC	2	6	6772	6777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
114	NC_020797	TTG	2	6	6884	6889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470464781
115	NC_020797	CG	3	6	6992	6997	0 %	0 %	50 %	50 %	470464781
116	NC_020797	GGT	2	6	7036	7041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464781
117	NC_020797	CGC	2	6	7049	7054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
118	NC_020797	TCG	2	6	7061	7066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
119	NC_020797	CG	3	6	7070	7075	0 %	0 %	50 %	50 %	470464781
120	NC_020797	CCAG	2	8	7113	7120	25 %	0 %	25 %	50 %	470464781
121	NC_020797	GTG	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470464781
122	NC_020797	CGA	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
123	NC_020797	CGG	2	6	7156	7161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
124	NC_020797	CGGT	2	8	7166	7173	0 %	25 %	50 %	25 %	470464781
125	NC_020797	GCC	2	6	7239	7244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470464781
126	NC_020797	GTC	2	6	7304	7309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
127	NC_020797	TCG	2	6	7403	7408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
128	NC_020797	GTC	2	6	7426	7431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464781
129	NC_020797	GGC	3	9	7537	7545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
130	NC_020797	GCG	2	6	7622	7627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
131	NC_020797	GCG	2	6	7639	7644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464781
132	NC_020797	CTGG	2	8	7696	7703	0 %	25 %	50 %	25 %	470464781
133	NC_020797	CAG	2	6	7738	7743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
134	NC_020797	CAG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464781
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264	NC_020797	GGC	2	6	16324	16329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470464785
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296	NC_020797	TGAG	2	8	18422	18429	25 %	25 %	50 %	0 %	470464786
297	NC_020797	AGC	2	6	18496	18501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470464786
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303	NC_020797	GTA	2	6	18861	18866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470464786
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